Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms