Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERCC6Q03468 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms