Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELNP78509 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELNP78509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELNP78509 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELNP78509 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELNP78509 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELNP78509 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELNP78509 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELNP78509 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELNP78509 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELNP78509 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms