Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F2P78329 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms