Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BACE1P56817 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BACE1P56817 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BACE1P56817 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BACE1P56817 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BACE1P56817 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BACE1P56817 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms