Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRPF1P55201 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms