Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms