Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA4P52798 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms