Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RORCP51449 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RORCP51449 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RORCP51449 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RORCP51449 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORCP51449 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORCP51449 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORCP51449 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORCP51449 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms