Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms