Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLMP48507 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCLMP48507 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLMP48507 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLMP48507 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms