Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A1P43005 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms