Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms