Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERBB3P21860 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms