Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZSCAN20P17040 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms