Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A3P13637 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A3P13637 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A3P13637 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A3P13637 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A3P13637 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms