Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms