Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMCP01189 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMCP01189 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMCP01189 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMCP01189 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMCP01189 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms