Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB5O95377 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB5O95377 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB5O95377 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB5O95377 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB5O95377 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB5O95377 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms