Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX3O95076 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX3O95076 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms