Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PDE6DO43924 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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