Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SIAH2O43255 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms