Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ2O15056 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ2O15056 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ2O15056 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ2O15056 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ2O15056 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms