Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms