Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC4A6NH21 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms