Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms