Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms