Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CD2APQ9Y5K6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms