Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF2Q9Y4G8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms