Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms