Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms