Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLEC11AQ9Y240 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC11AQ9Y240 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms