Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN6Q9UQ52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms