Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms