Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSRAQ9UJ68 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms