Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms