Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 516.23■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 LATS1-204ENST00000458696 602 ntTSL 316.08■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 516.01■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 246.8
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-11■■■■■ 246.7
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.84□□□□□ -0.515e-11■■■■■ 246.7
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 211.58□□□□□ -0.555e-11■■■■■ 246.7
UTP3Q9NQZ2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.843e-11■■■■■ 246.5
UTP3Q9NQZ2 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-11■■■■■ 246.5
UTP3Q9NQZ2 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.53e-11■■■■■ 246.5
UTP3Q9NQZ2 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.53e-11■■■■■ 246.5
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.312e-8■■■■■ 246.4
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.012e-8■■■■■ 246.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 319.35■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 413.09□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 212.58□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 312.24□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 511.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 311.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 311.09□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 311.09□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 310.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 310.38□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 48.73□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 47.54□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 46.88□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 246.1
UTP3Q9NQZ2 CC2D1A-203ENST00000586955 2743 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 246
UTP3Q9NQZ2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 246
UTP3Q9NQZ2 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-8■■■■■ 246
UTP3Q9NQZ2 SORT1-203ENST00000471996 469 ntTSL 320.1■□□□□ 0.813e-51■■■■■ 245.9
UTP3Q9NQZ2 CEP95-216ENST00000582724 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.65□□□□□ -1.023e-47■■■■■ 245.9
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-203ENST00000526183 4311 ntTSL 216.66■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 245.9
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 245.9
UTP3Q9NQZ2 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 322.53■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 220.07■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 245.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-215ENST00000576922 1468 ntTSL 518.08■□□□□ 0.492e-21■■■■■ 245.3
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-209ENST00000574430 652 ntTSL 317.69■□□□□ 0.422e-21■■■■■ 245.3
UTP3Q9NQZ2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.75e-10■■■■■ 245.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 245.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■■ 245.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 245.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 245.2
UTP3Q9NQZ2 MCM9-208ENST00000505485 825 ntTSL 417.76■□□□□ 0.438e-12■■■■■ 244.9
UTP3Q9NQZ2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.128e-12■■■■■ 244.9
UTP3Q9NQZ2 MCM9-203ENST00000368478 469 ntTSL 29.31□□□□□ -0.928e-12■■■■■ 244.9
UTP3Q9NQZ2 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.398e-12■■■■■ 244.9
UTP3Q9NQZ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 244.4
UTP3Q9NQZ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 244
UTP3Q9NQZ2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 244
UTP3Q9NQZ2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 244
UTP3Q9NQZ2 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 516.74■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 244
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-211ENST00000480424 2202 ntTSL 218.89■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 243.9
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-217ENST00000635205 936 ntTSL 517.01■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 243.9
UTP3Q9NQZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 243.8
UTP3Q9NQZ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 243.8
UTP3Q9NQZ2 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 243.8
UTP3Q9NQZ2 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 243.8
UTP3Q9NQZ2 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 243.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.317e-10■■■■■ 243.4
UTP3Q9NQZ2 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 325.32■■□□□ 1.646e-7■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.357e-10■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.457e-10■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.477e-10■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 58.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 28.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 243.2
UTP3Q9NQZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.451e-10■■■■■ 243.1
UTP3Q9NQZ2 CDR2-204ENST00000564542 1056 ntTSL 514.88□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 243.1
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 242.9
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 216.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 242.9
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-12■■■■■ 242.8
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.091e-12■■■■■ 242.8
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-213ENST00000590790 994 ntTSL 515.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 242.8
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-217ENST00000593224 498 ntTSL 511.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 242.8
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 218.41■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 242.7
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 216.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 242.6
UTP3Q9NQZ2 TEAD1-204ENST00000527376 477 ntTSL 323.09■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 242.5
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-208ENST00000506218 758 ntTSL 325.48■■□□□ 1.673e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.643e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 225.3■■□□□ 1.643e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-212ENST00000508120 536 ntTSL 324.25■■□□□ 1.473e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.343e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-207ENST00000484394 1927 ntTSL 222.93■■□□□ 1.263e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 222.24■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-9■■■■■ 242.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 574.3 ms