Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP3Q9H6T3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms