Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEF6Q9H4E7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEF6Q9H4E7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms