Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD5Q9GZQ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms