Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms