Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMKK2Q96RR4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAMKK2Q96RR4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMKK2Q96RR4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms