Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms