Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms