Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM17Q96I25 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms