Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRP36Q96EU6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms