Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHFRQ96EP1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CHFRQ96EP1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CHFRQ96EP1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CHFRQ96EP1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CHFRQ96EP1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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