Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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