Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRG4Q92954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms