Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms